V Hluboké nad Vltavou najdete pestrou nabídku penzionů, které se soustředí především v blízkosti dominanty města - zámku Hluboká. Tyto penziony jsou ideální pro rodiny i páry, které hledají cenově dostupné ubytování s osobním přístupem. Většina z nich nabízí rodinné pokoje, parkování zdarma a Wi-Fi. Snídaně bývá často zahrnuta nebo za příplatek, a mnohé penziony se pyšní výjimečným hodnocením za kvalitu jídla. Průměrné hodnocení místních penzionů se pohybuje od 75 do 97 bodů, což svědčí o vysoké spokojenosti hostů.
Mezi nejlépe hodnocené patří Residence Hluboká (97 bodů) s apartmány s kuchyňkou, zahradou a výbornou snídaní, což ocení milovníci samostatného vaření. Penzion Masarykova 37 (96 bodů) láká na klimatizované pokoje a výjimečnou snídani. Rodiny s dětmi oceňují Penzion a hospodu Na statku (91 bodů) s vlastní restaurací a dětským hřištěm, zatímco Pension Ka.Pr (90 bodů) je oblíbený díky baru a skvělé snídani. Pro milovníky historie je zajímavý Četnická stanice Hluboká (90 bodů) v historické budově s možností ubytování se psem. Relax Hotel Pelikán (75 bodů) nabízí wellness a lázně pro relaxaci po prohlídce zámku.