Penziony v Kutné Hoře nabízejí cenově dostupné ubytování v historickém centru i blízké okolí. Většina z nich poskytuje bezplatné parkování, WiFi a snídani formou bufetu. Ceny se pohybují od 1 500 Kč za noc v základním pokoji, s možností připlatit si za pokoj s vlastním balkonem nebo klimatizací. Nejlepší lokality pro ubytování jsou ulice v docházkové vzdálenosti od Chrámu svaté Barbory a Kostnice v Sedlci.
Mezi nejlépe hodnocené patří Penzion U Hrádku (94/100) s výhledem na město a bezplatným parkováním, Café Havlíček Penzion (93/100) s vynikající snídaní a historickým prostředím, a Boutique Hotel Soukeníkův dům (95/100) nabízející lázeňské procedury. Rodiny ocení Penzion Kutna (93/100) s klidnou zahradou, zatímco párům doporučíme Penzion U Babky bylinkářky (90/100) s kuchyňkou a blízkostí Galerie Felixe Jeneweina.