Penziony v Špindlerově Mlýně jsou oblíbenou volbou pro rodiny s dětmi i páry hledající klid. Nabízejí nižší ceny než hotely, ale často srovnatelné vybavení - vlastní koupelny, satelitní TV a Wi-Fi zdarma. Většina z nich poskytuje parkování na místě a snídani v ceně. Ubytování se nachází v různých částech města - od centra, kde je vše na dosah, až po horské chaty u sjezdovek Svatý Petr a Medvědín. Průměrná cena za noc se pohybuje od 1 500 do 3 000 Kč, v závislosti na sezóně a vybavení.
Mezi nejlépe hodnocené penziony patří Pension Pohoda (hodnocení 93) s vlastní saunou a masážemi, rodinný Pension Krakonoš (95) se ski-to-door přístupem a dětským hřištěm, nebo Pension Slunečnice (94) s moderním wellness a restaurací s českou kuchyní. Pro milovníky horské atmosféry je tu Moravská Bouda (89) s výhledem na Krkonoše a dětským klubem. Pokud hledáte klid u Labské přehrady, zvolte Pension Happy Superior (92). Všechny zmíněné penziony mají výborné hodnocení a nabízejí sklad na lyže, Wi-Fi zdarma a možnost zapůjčení sportovního vybavení.