Levné ubytování v Klatovech nabízí především rodinné penziony a menší hotely v centru města. Hosté mohou počítat s cenově dostupnými pokoji, které často zahrnují bezplatné Wi-Fi, snídani a parkování. Pro rodiny s dětmi jsou k dispozici dětská hřiště a rodinné pokoje, zatímco jednotliví cestovatelé ocení klidné lokality s výhledem do zahrady nebo na náměstí.
Mezi nejlépe hodnocené patří Hotel Ennius (83 bodů) s restaurací a recepcí 24/7, Penzion Kotva (89 bodů) v historické budově s výbornou snídaní a Steak Restaurant Penzion Country Saloon (90 bodů) s dětským hřištěm a večerní zábavou. Většina zařízení nabízí možnost ubytování s vlastním vstupem a úschovnou zavazadel.